Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms