Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Usp16Q99LG0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp16Q99LG0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms