Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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