Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctu1Q99J10 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms