Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Cldn16Q925N4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Cldn16Q925N4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Cldn16Q925N4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Cldn16Q925N4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Cldn16Q925N4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Cldn16Q925N4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Cldn16Q925N4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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