Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hps3Q91VB4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hps3Q91VB4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms