Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8513-201ENSMUST00000182830 1003 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45437-202ENSMUST00000211418 694 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms