Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgtbQ8VD33 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms