Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Rdh10Q8VCH7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rdh10Q8VCH7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms