Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcsapQ8QZT2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms