Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MyripQ8K3I4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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