Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Vrk3Q8K3G5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Vrk3Q8K3G5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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