Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ssh3Q8K330 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ssh3Q8K330 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ssh3Q8K330 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms