Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Znf628Q8CJ78 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Znf628Q8CJ78 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms