Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms