Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc28aQ8CEI3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc28aQ8CEI3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms