Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrif1Q8CDD9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms