Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4933409G03RikQ8C5U0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms