Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8C5C9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Q8C5C9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Q8C5C9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Q8C5C9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Q8C5C9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8C5C9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Q8C5C9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Q8C5C9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Q8C5C9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Q8C5C9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Q8C5C9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Q8C5C9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8C5C9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms