Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssuh2Q8C3L1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms