Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Amigo3Q8C2S7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms