Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube3dQ8BX13 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms