Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms