Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp38Q8BW70 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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