Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms