Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD5

She, SH2 domain-containing adapter protein E, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SheQ8BSD5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SheQ8BSD5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms