Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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