Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.6Q85ZW5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms