Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ChfrQ810L3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ChfrQ810L3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ChfrQ810L3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ChfrQ810L3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ChfrQ810L3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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