Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ttc28Q80XJ3 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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