Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnf1Q7TSH7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms