Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shq1Q7TMX5 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms