Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim12Q78RX3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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