Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rph3alQ768S4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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