Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd4Q6PDQ2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd4Q6PDQ2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd4Q6PDQ2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd4Q6PDQ2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd4Q6PDQ2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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