Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trim37Q6PCX9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trim37Q6PCX9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trim37Q6PCX9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim37Q6PCX9 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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