Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp49Q6P9L4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp49Q6P9L4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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