Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm4Q6IRU2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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