Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pdzrn3Q69ZS0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms