Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Msl2Q69ZF8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms