Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pkp4Q68FH0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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