Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtafrQ62035 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms