Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Itga6Q61739 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms