Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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PcolceQ61398 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PcolceQ61398 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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