Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf3Q60980 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms