Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp7Q60973 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms