Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Samhd1Q60710 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms