Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Bod1Q5SQY2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Bod1Q5SQY2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms