Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Phf12Q5SPL2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms