Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
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Trappc1Q5NCF2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Trappc1Q5NCF2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
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